MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycoplasma conjunctivae HRC/581 chromosome

Total Repeats: 21197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012806	CAAT	2	8	129	136	50 %	25 %	0 %	25 %	240047136
2	NC_012806	ATA	2	6	168	173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
3	NC_012806	TAA	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
4	NC_012806	T	6	6	187	192	0 %	100 %	0 %	0 %	240047136
5	NC_012806	AAT	2	6	205	210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
6	NC_012806	ATC	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047136
7	NC_012806	A	7	7	259	265	100 %	0 %	0 %	0 %	240047136
8	NC_012806	CAAG	2	8	376	383	50 %	0 %	25 %	25 %	240047136
9	NC_012806	GTT	2	6	389	394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047136
10	NC_012806	AAAT	2	8	411	418	75 %	25 %	0 %	0 %	240047136
11	NC_012806	ACA	2	6	453	458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047136
12	NC_012806	ATT	2	6	461	466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047136
13	NC_012806	ATT	2	6	536	541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047136
14	NC_012806	A	7	7	543	549	100 %	0 %	0 %	0 %	240047136
15	NC_012806	T	7	7	554	560	0 %	100 %	0 %	0 %	240047136
16	NC_012806	TTTA	2	8	569	576	25 %	75 %	0 %	0 %	240047136
17	NC_012806	A	6	6	634	639	100 %	0 %	0 %	0 %	240047136
18	NC_012806	T	6	6	651	656	0 %	100 %	0 %	0 %	240047136
19	NC_012806	AAAT	2	8	723	730	75 %	25 %	0 %	0 %	240047136
20	NC_012806	ATTA	2	8	763	770	50 %	50 %	0 %	0 %	240047136
21	NC_012806	TGA	2	6	772	777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047136
22	NC_012806	TAA	2	6	793	798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
23	NC_012806	ATA	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
24	NC_012806	GAA	2	6	845	850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047136
25	NC_012806	C	7	7	879	885	0 %	0 %	0 %	100 %	240047136
26	NC_012806	CAA	2	6	960	965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047136
27	NC_012806	AAG	2	6	966	971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047136
28	NC_012806	GAA	3	9	1001	1009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047136
29	NC_012806	ATT	2	6	1023	1028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047136
30	NC_012806	T	6	6	1048	1053	0 %	100 %	0 %	0 %	240047136
31	NC_012806	GGAG	2	8	1087	1094	25 %	0 %	75 %	0 %	240047136
32	NC_012806	A	6	6	1099	1104	100 %	0 %	0 %	0 %	240047136
33	NC_012806	ATA	2	6	1106	1111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
34	NC_012806	TGA	2	6	1126	1131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047136
35	NC_012806	TTTC	2	8	1155	1162	0 %	75 %	0 %	25 %	240047136
36	NC_012806	GAA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047136
37	NC_012806	A	6	6	1212	1217	100 %	0 %	0 %	0 %	240047136
38	NC_012806	TAA	2	6	1230	1235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
39	NC_012806	AT	3	6	1320	1325	50 %	50 %	0 %	0 %	240047136
40	NC_012806	AAT	2	6	1333	1338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047136
41	NC_012806	CAA	2	6	1401	1406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047136
42	NC_012806	TAAAA	2	10	1648	1657	80 %	20 %	0 %	0 %	240047137
43	NC_012806	A	7	7	1654	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	240047137
44	NC_012806	CT	3	6	1724	1729	0 %	50 %	0 %	50 %	240047137
45	NC_012806	TAT	2	6	1733	1738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047137
46	NC_012806	CAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047137
47	NC_012806	TTA	2	6	1803	1808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047137
48	NC_012806	CAT	2	6	1825	1830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047137
49	NC_012806	T	8	8	1859	1866	0 %	100 %	0 %	0 %	240047137
50	NC_012806	A	6	6	1867	1872	100 %	0 %	0 %	0 %	240047137
51	NC_012806	ATT	2	6	1874	1879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047137
52	NC_012806	A	7	7	1880	1886	100 %	0 %	0 %	0 %	240047137
53	NC_012806	A	7	7	2041	2047	100 %	0 %	0 %	0 %	240047137
54	NC_012806	AC	3	6	2058	2063	50 %	0 %	0 %	50 %	240047137
55	NC_012806	CTT	2	6	2073	2078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047137
56	NC_012806	TATTAA	2	12	2107	2118	50 %	50 %	0 %	0 %	240047137
57	NC_012806	A	6	6	2233	2238	100 %	0 %	0 %	0 %	240047137
58	NC_012806	TTCC	2	8	2244	2251	0 %	50 %	0 %	50 %	240047137
59	NC_012806	TTAC	2	8	2301	2308	25 %	50 %	0 %	25 %	240047137
60	NC_012806	CAAA	2	8	2324	2331	75 %	0 %	0 %	25 %	240047137
61	NC_012806	AT	3	6	2390	2395	50 %	50 %	0 %	0 %	240047137
62	NC_012806	A	8	8	2409	2416	100 %	0 %	0 %	0 %	240047137
63	NC_012806	A	7	7	2491	2497	100 %	0 %	0 %	0 %	240047137
64	NC_012806	TAA	2	6	2586	2591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047137
65	NC_012806	GAAA	2	8	2660	2667	75 %	0 %	25 %	0 %	240047137
66	NC_012806	ATC	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047137
67	NC_012806	A	6	6	2697	2702	100 %	0 %	0 %	0 %	240047137
68	NC_012806	CATA	2	8	2756	2763	50 %	25 %	0 %	25 %	240047138
69	NC_012806	A	6	6	2782	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	240047138
70	NC_012806	TTC	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047138
71	NC_012806	TGA	2	6	2892	2897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047138
72	NC_012806	TTTG	2	8	2899	2906	0 %	75 %	25 %	0 %	240047138
73	NC_012806	ATG	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047138
74	NC_012806	AATT	2	8	2918	2925	50 %	50 %	0 %	0 %	240047138
75	NC_012806	ATA	2	6	2949	2954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047138
76	NC_012806	A	6	6	2954	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
77	NC_012806	TAG	2	6	2970	2975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047139
78	NC_012806	TGG	3	9	2977	2985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047139
79	NC_012806	A	6	6	3020	3025	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
80	NC_012806	TAA	2	6	3042	3047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047139
81	NC_012806	TGG	2	6	3094	3099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047139
82	NC_012806	TGG	2	6	3139	3144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047139
83	NC_012806	GCAA	2	8	3148	3155	50 %	0 %	25 %	25 %	240047139
84	NC_012806	GAT	2	6	3172	3177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047139
85	NC_012806	A	6	6	3278	3283	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
86	NC_012806	CAAAAA	2	12	3331	3342	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	240047139
87	NC_012806	A	7	7	3363	3369	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
88	NC_012806	T	7	7	3376	3382	0 %	100 %	0 %	0 %	240047139
89	NC_012806	TTC	2	6	3429	3434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047139
90	NC_012806	CTT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047139
91	NC_012806	ATCAG	2	10	3478	3487	40 %	20 %	20 %	20 %	240047139
92	NC_012806	A	6	6	3493	3498	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
93	NC_012806	AATTA	2	10	3502	3511	60 %	40 %	0 %	0 %	240047139
94	NC_012806	ACC	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047139
95	NC_012806	AGA	2	6	3592	3597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047139
96	NC_012806	TTTTTC	2	12	3619	3630	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	240047139
97	NC_012806	AAT	2	6	3697	3702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047139
98	NC_012806	ATTA	2	8	3739	3746	50 %	50 %	0 %	0 %	240047139
99	NC_012806	CAA	2	6	3801	3806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047139
100	NC_012806	T	6	6	3824	3829	0 %	100 %	0 %	0 %	240047139
101	NC_012806	A	6	6	3842	3847	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
102	NC_012806	ATG	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047139
103	NC_012806	A	8	8	4015	4022	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
104	NC_012806	AAAT	2	8	4047	4054	75 %	25 %	0 %	0 %	240047139
105	NC_012806	AGC	2	6	4075	4080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240047139
106	NC_012806	A	6	6	4116	4121	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
107	NC_012806	ATG	2	6	4155	4160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047139
108	NC_012806	GAT	2	6	4181	4186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047139
109	NC_012806	GAA	2	6	4319	4324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047139
110	NC_012806	A	7	7	4361	4367	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
111	NC_012806	A	6	6	4415	4420	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
112	NC_012806	AATT	2	8	4452	4459	50 %	50 %	0 %	0 %	240047139
113	NC_012806	TGC	2	6	4564	4569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047139
114	NC_012806	A	6	6	4572	4577	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
115	NC_012806	ATT	2	6	4617	4622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047139
116	NC_012806	TCT	2	6	4640	4645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047139
117	NC_012806	A	7	7	4663	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
118	NC_012806	CAAG	2	8	4691	4698	50 %	0 %	25 %	25 %	240047139
119	NC_012806	CTG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047139
120	NC_012806	A	7	7	4767	4773	100 %	0 %	0 %	0 %	240047139
121	NC_012806	TATAA	2	10	4876	4885	60 %	40 %	0 %	0 %	240047140
122	NC_012806	ATT	2	6	4887	4892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047140
123	NC_012806	A	6	6	4929	4934	100 %	0 %	0 %	0 %	240047140
124	NC_012806	A	6	6	4936	4941	100 %	0 %	0 %	0 %	240047140
125	NC_012806	AAT	2	6	4953	4958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047140
126	NC_012806	A	6	6	4961	4966	100 %	0 %	0 %	0 %	240047140
127	NC_012806	A	6	6	4971	4976	100 %	0 %	0 %	0 %	240047140
128	NC_012806	CTTTT	2	10	4985	4994	0 %	80 %	0 %	20 %	240047140
129	NC_012806	CAA	2	6	5033	5038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047140
130	NC_012806	TA	3	6	5062	5067	50 %	50 %	0 %	0 %	240047140
131	NC_012806	ATT	2	6	5122	5127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047140
132	NC_012806	T	7	7	5126	5132	0 %	100 %	0 %	0 %	240047140
133	NC_012806	CA	3	6	5156	5161	50 %	0 %	0 %	50 %	240047140
134	NC_012806	AATT	2	8	5171	5178	50 %	50 %	0 %	0 %	240047140
135	NC_012806	A	6	6	5250	5255	100 %	0 %	0 %	0 %	240047141
136	NC_012806	CCA	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047141
137	NC_012806	T	6	6	5399	5404	0 %	100 %	0 %	0 %	240047141
138	NC_012806	CGA	2	6	5450	5455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240047141
139	NC_012806	A	6	6	5472	5477	100 %	0 %	0 %	0 %	240047141
140	NC_012806	CAC	2	6	5586	5591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047141
141	NC_012806	GAA	2	6	5607	5612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047141
142	NC_012806	TTG	2	6	5644	5649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047141
143	NC_012806	TGA	2	6	5677	5682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047141
144	NC_012806	GCT	2	6	5793	5798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047141
145	NC_012806	T	6	6	5798	5803	0 %	100 %	0 %	0 %	240047141
146	NC_012806	GATTT	2	10	5815	5824	20 %	60 %	20 %	0 %	240047141
147	NC_012806	AAATT	2	10	5829	5838	60 %	40 %	0 %	0 %	240047141
148	NC_012806	A	6	6	5850	5855	100 %	0 %	0 %	0 %	240047141
149	NC_012806	GAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047141
150	NC_012806	A	6	6	5901	5906	100 %	0 %	0 %	0 %	240047141
151	NC_012806	AGA	2	6	5966	5971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047141
152	NC_012806	ATA	2	6	6010	6015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047141
153	NC_012806	GAATTT	2	12	6016	6027	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	240047141
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155	NC_012806	GGT	2	6	6111	6116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047141
156	NC_012806	A	6	6	6148	6153	100 %	0 %	0 %	0 %	240047141
157	NC_012806	TTG	2	6	6172	6177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047141
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159	NC_012806	TGT	2	6	6237	6242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047142
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161	NC_012806	A	6	6	6263	6268	100 %	0 %	0 %	0 %	240047142
162	NC_012806	TCA	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047142
163	NC_012806	AATT	2	8	6332	6339	50 %	50 %	0 %	0 %	240047142
164	NC_012806	A	6	6	6384	6389	100 %	0 %	0 %	0 %	240047142
165	NC_012806	GAA	2	6	6436	6441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047142
166	NC_012806	AAT	2	6	6459	6464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047142
167	NC_012806	GAATT	2	10	6488	6497	40 %	40 %	20 %	0 %	240047142
168	NC_012806	AAT	2	6	6531	6536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047142
169	NC_012806	ATG	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047142
170	NC_012806	AAT	2	6	6643	6648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047142
171	NC_012806	ACA	2	6	6727	6732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047142
172	NC_012806	T	6	6	6744	6749	0 %	100 %	0 %	0 %	240047142
173	NC_012806	AGC	2	6	6750	6755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240047142
174	NC_012806	A	7	7	6811	6817	100 %	0 %	0 %	0 %	240047142
175	NC_012806	T	7	7	6845	6851	0 %	100 %	0 %	0 %	240047142
176	NC_012806	A	7	7	6856	6862	100 %	0 %	0 %	0 %	240047142
177	NC_012806	TTA	2	6	6879	6884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047142
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180	NC_012806	AAG	2	6	6995	7000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047142
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182	NC_012806	CTC	2	6	7029	7034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240047142
183	NC_012806	GGT	3	9	7069	7077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047142
184	NC_012806	TAA	2	6	7133	7138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047142
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186	NC_012806	AAATT	2	10	7252	7261	60 %	40 %	0 %	0 %	240047143
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190	NC_012806	TTG	2	6	7370	7375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047143
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199	NC_012806	T	6	6	7761	7766	0 %	100 %	0 %	0 %	240047143
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255	NC_012806	T	6	6	10449	10454	0 %	100 %	0 %	0 %	240047145
256	NC_012806	ATT	2	6	10455	10460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047145
257	NC_012806	CTT	2	6	10478	10483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047145
258	NC_012806	TTC	2	6	10488	10493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047145
259	NC_012806	A	6	6	10511	10516	100 %	0 %	0 %	0 %	240047145
260	NC_012806	CACC	2	8	10541	10548	25 %	0 %	0 %	75 %	240047145
261	NC_012806	ATAA	2	8	10566	10573	75 %	25 %	0 %	0 %	240047145
262	NC_012806	CTT	2	6	10699	10704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047145
263	NC_012806	T	6	6	10733	10738	0 %	100 %	0 %	0 %	240047145
264	NC_012806	ACA	2	6	10759	10764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047145
265	NC_012806	ATT	2	6	10836	10841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047145
266	NC_012806	GTG	2	6	10856	10861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047145
267	NC_012806	TGT	2	6	10871	10876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047145
268	NC_012806	TTTTA	2	10	10893	10902	20 %	80 %	0 %	0 %	240047145
269	NC_012806	TAA	2	6	11276	11281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047146
270	NC_012806	A	6	6	11283	11288	100 %	0 %	0 %	0 %	240047146
271	NC_012806	A	7	7	11355	11361	100 %	0 %	0 %	0 %	240047146
272	NC_012806	A	6	6	11363	11368	100 %	0 %	0 %	0 %	240047146
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